Leggyakrabban a más módon nem kezelhető hólyagdaganat gyógyítása céljából történik cisztektómia. Műtéttel már nem teljesen gyógyítható hólyagrák mellett is szükség lehet erre a műtétre, hogy a visszatérő vérzéstől, a fájdalmaktól a beteg megszabaduljon.
A hólyag működése daganatos megbetegedés nélkül is sérülhet, pl. gyulladás vagy megelőző kezelés, besugárzás miatt. Néha ez olyan mértékű, hogy a betegnek elviselhetetlen szenvedést okoz, és a vesék működését is veszélyezteti. Leggyakoribb a hólyag heges átalakulása, az ún. zsugorhólyag, amikor a hólyag képtelen kitágulni és a vizeletet tárolni. Ilyenkor a vizelet elterelése, esetleg a hólyag
eltávolításával együtt, megoldást jelenthet.
A hólyag sérülése, súlyos vérzése (pl. gyulladás miatt), vagy fisztulanyílás (más szervbe, bőrfelszínre, bélbe vezető összeköttetés) kialakulása esetén is előfordul, hogy más módszerrel, műtéttel a hólyag nem kezelhető, vagy nem helyreállítható. Ilyen kényszerű helyzetben is szükség lehet a hólyag eltávolítására.
